Des de fa molts anys, la Secció d’ornitologia del GOB, duu a terme una sèrie d’esforços que es dediquen a la divulgació, la investigació, els estudis ornitològics de caire científic i la posada en marxa de projectes de conservació d’espècies amenaçades.

Programa de Seguiment d’Aucells Comuns (SAC).
Aquest estudi té per objectiu principal conèixer l'evolució i les tendències que es produeixen en l'abundància dels aucells més comuns a les Balears. La informació recollida permet determinar l'estat de conservació de les diferents espècies. L'anàlisi d'aquests índex recollits al llarg del temps ens permetrà detectar tendències i canvis en les poblacions, les quals poden avisar de canvis en l'estat dels ecosistemes on viuen aquests aucells

Estacions d'anellament d'esforç constant
Les estacions d'anellament d'esforç constant són de gran utilitat com a eines de seguiment i estudi d'aucells, permeten obtindre importants dades amb una aplicació directa en l'àmbit de la gestió i conservació d'espècies. A Mallorca el GOB gestiona varies estacions d'anellament ubicades a diferents espais naturals, i ja s'han començat a veure alguns resultats interessants.

Projecte Piccole Isole
Piccole Isole és un projecte internacional de recerca que des de fa més de 20 anys es dedica a estudiar la migració dels aucells a través de la Mediterrànica i la importància de les illes en aquesta migració, mitjançant una xarxa d'estacions d'anellament. Moltes de les estacions estan situades a petites illes (per això el nom de Piccole Isole, illa petita). A Mallorca el GOB gestiona dues estacions que han proporcionat dades per aquest projecte, i que estan situades al parc Nacional de Cabrera i al Parc Natural de sa Dragonera.

Recomptes i censos
Les concentracions regulars de determinats tipus d'aucells a una àrea concreta (dormidors, colònies de cria, àrees d'hivernada...), permet realitzar censos i recomptes anuals. Poder comptabilitzar les aus any rera any permet saber o detectar si se produeixen fluctuacions significatives a les poblacions estudiades, i detectar canvis o alteracions en els ecosistemes propis, però també externs. Voluntaris del GOB participen en els recomptes i censos més importants que se realitzen a Balears, entre ells el recompte d'aucells aquàtics hivernants que se du a terme a les zones humides de tota Europa i part dels Estats Units.